ntsyspc(分子生物學分析軟件) v2.10e

ntsyspc是一款來自國外非常知名的分子生物學分析軟件。主要可為從事生物研究者提供生物群體聚類分析及相似性分析，并自動計算相關遺傳距離，分析聚類樹繪圖等操作，可利用Ntedit直接錄入數據，從excel表中直接讀入數據，還可以從文本文件進行讀取數據。專業(yè)性很強，有需要的便宜請下載。

ntsyspc表型聚類分析

1、數據格式整理

格式和注意事項與分子標記格式相同，表型數據導入時，表型數目等同于標記數目，表型名稱可以簡化為數字，表型缺失數據用-999表示。另存為nts格式的操作和標記基因型一致，在此不再詳述。

2、數據標準化

在Output&transf.菜單下選擇，彈出下圖界面，在Input file和Output file分別設置表型數據文件和標準化后的存儲文件。設置好后點擊Compute運行。

3、歐式距離矩陣計算

選擇Similarity菜單下的Interval data，Input file選擇標準化后的.nts數據文件，運算函數Coefficient選擇EUCLID，數據保存在Output file，格式設為.nts。

功能特色

1、相似性和差異性：關聯、距離、34個關聯系數和11個遺傳距離系數。

2、聚類：UPGMA和其他等級結構的SAHN方法（可以是多重關系）、鄰接法和共同樹的幾種形式。

3、圖論方法：最短長度的生成樹和用鄰接法繪制圖片（可以是無根系統(tǒng)樹）。

4、 排序：主成分或主坐標分析、對應分析、度量與非度量多維尺度分析、奇異值分析和Burnaby方法、典型分布隨機分析、方案的多因素分析、常見的主成分分析、偏最小二乘、多關聯性和典型相關。

5、圖片互動：表征圖、物種樹、二維散點圖，相似性和差異性矩陣的對比、傅立葉的大綱圖、Procrustes繪圖和三維視點繪圖。

6、多變量測試：典型變量分析、協方差矩陣測試、維數測試、廣義多元回歸分析。同時還有輔導程序和模擬實驗內容。

7、幾何形態(tài)測量：包括Procrustes分析的特殊組件，用于疊加重點結構，繪制Procrutes分析的結果圖片，繪制輪廓圖片和輪廓形狀的傅立葉系數（包括2D和3D橢圓圖片）和部分2D和3D的彎曲系數并估算統(tǒng)一部分。

8、其他：由同表象相關、Mantel測試，3-way Mantel測試，數據標準化和矩陣轉化等進行矩陣對比。矩陣可分割或合并。